Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hoxd13P70217 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Hoxd13P70217 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd13P70217 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd13P70217 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd13P70217 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd13P70217 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Hoxd13P70217 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms