Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Traf5P70191 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf5P70191 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf5P70191 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Traf5P70191 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms