Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barhl1P63157 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barhl1P63157 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barhl1P63157 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barhl1P63157 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barhl1P63157 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barhl1P63157 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barhl1P63157 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Barhl1P63157 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Barhl1P63157 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Barhl1P63157 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Barhl1P63157 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barhl1P63157 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Barhl1P63157 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms