Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UbdP63072 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbdP63072 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbdP63072 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbdP63072 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbdP63072 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UbdP63072 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbdP63072 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbdP63072 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbdP63072 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbdP63072 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbdP63072 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
UbdP63072 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UbdP63072 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UbdP63072 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UbdP63072 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UbdP63072 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UbdP63072 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UbdP63072 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms