Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba52P62984 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Uba52P62984 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Uba52P62984 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Uba52P62984 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms