Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl30P62889 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl30P62889 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms