Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl23P62830 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl23P62830 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms