Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl23aP62751 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23aP62751 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23aP62751 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23aP62751 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23aP62751 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23aP62751 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rpl23aP62751 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms