Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf6P62331 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arf6P62331 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arf6P62331 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Arf6P62331 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf6P62331 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf6P62331 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf6P62331 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf6P62331 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Arf6P62331 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms