Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps11P62281 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps11P62281 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps11P62281 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rps11P62281 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rps11P62281 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms