Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnd3P61588 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnd3P61588 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms