Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg6P61406 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smg6P61406 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Smg6P61406 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg6P61406 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg6P61406 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg6P61406 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Smg6P61406 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Smg6P61406 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms