Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abce1P61222 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abce1P61222 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abce1P61222 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms