Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2kP61087 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube2kP61087 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms