Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap25P60879 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap25P60879 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Snap25P60879 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snap25P60879 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snap25P60879 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms