Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps5P59438 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps5P59438 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps5P59438 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps5P59438 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps5P59438 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hps5P59438 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hps5P59438 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hps5P59438 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Hps5P59438 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms