Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nphp4P59240 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nphp4P59240 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nphp4P59240 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms