Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Csrnp1P59054 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Csrnp1P59054 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms