Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33bP59016 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33bP59016 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms