Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tm9sf2P58021 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tm9sf2P58021 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tm9sf2P58021 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms