Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Samsn1P57725 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Samsn1P57725 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms