Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Usp25P57080 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp25P57080 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp25P57080 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms