Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctbp2P56546 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.9 ms