Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd38P56528 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd38P56528 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd38P56528 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms