Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp1P56183 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rrp1P56183 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rrp1P56183 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms