Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp1P55194 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp1P55194 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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