Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtskP55097 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtskP55097 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CtskP55097 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CtskP55097 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CtskP55097 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CtskP55097 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CtskP55097 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtskP55097 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CtskP55097 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtskP55097 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CtskP55097 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CtskP55097 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CtskP55097 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtskP55097 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtskP55097 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtskP55097 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms