Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rad23bP54728 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rad23bP54728 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms