Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rad23aP54726 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rad23aP54726 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms