Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rab2aP53994 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab2aP53994 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms