Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lbx1P52955 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lbx1P52955 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms