Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Upp1P52624 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp1P52624 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Upp1P52624 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Upp1P52624 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms