Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2e3P52483 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2e3P52483 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms