Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApodP51910 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApodP51910 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApodP51910 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApodP51910 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ApodP51910 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ApodP51910 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApodP51910 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApodP51910 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ApodP51910 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApodP51910 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApodP51910 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApodP51910 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApodP51910 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApodP51910 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ApodP51910 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ApodP51910 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ApodP51910 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ApodP51910 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms