Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RoraP51448 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RoraP51448 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RoraP51448 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RoraP51448 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RoraP51448 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RoraP51448 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RoraP51448 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RoraP51448 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RoraP51448 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms