Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl5P50228 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl5P50228 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms