Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cdk5P49615 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdk5P49615 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms