Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atoh1P48985 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh1P48985 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms