Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Abcd1P48410 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms