Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl11P48298 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccl11P48298 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms