Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl5P47962 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl5P47962 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms