Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rplp1P47955 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rplp1P47955 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms