Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf4P43488 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf4P43488 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms