Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tlx1P43345 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tlx1P43345 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms