Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rpl28P41105 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rpl28P41105 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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