Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ThpoP40226 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ThpoP40226 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ThpoP40226 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ThpoP40226 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms