Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Timp3P39876 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Timp3P39876 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timp3P39876 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms