Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PpargP37238 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PpargP37238 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PpargP37238 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PpargP37238 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PpargP37238 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms