Protein–RNA interactions for Protein: P35979

Rpl12, 60S ribosomal protein L12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl12P35979 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl12P35979 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl12P35979 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms