Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PtprkP35822 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PtprkP35822 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprkP35822 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprkP35822 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PtprkP35822 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms